Révélée au grand public lorsqu'elle reçoit une Victoire de la Musique en 2002, Emmanuelle Bertrand est une des figures incontournables du violoncelle français. Formée par Jean Deplace et Philippe Muller dans les Conservatoires Nationaux Supérieurs de Musique de Lyon et de Paris, elle remporte le Premier Prix du Concours de Musique de Chambre du Japon à Tokyo et le Prix de l'Académie Internationale Maurice Ravel, et devient lauréate de la Fondation d'Entreprise Natexis et du Concours International Rostropovitch.

En 1999 elle rencontre le compositeur Henri Dutilleux dont le soutien est déterminant : "Son interprétation m'a immédiatement comblé par la transparence de la sonorité, la rigueur rythmique, la perfection technique, le brio du jeu. Je n'hésite pas à dire qu'il s'agit pour moi d'une véritable révélation"

Emmanuelle est par ailleurs dédicataire d'oeuvres composées par Nicolas Bacri, Edith Canat de Chizy, Janez Maticic et Pascal Amoyel. En 2000, elle donne en première audition mondiale la dernière oeuvre pour violoncelle seul de Luciano Berio : Chanson pour Pierre Boulez. En 2002, elle s'est vue décerner le Grand Prix de la Critique par le Syndicat Professionnel de la Critique Dramatique et Musicale récompensant la "Révélation Musicale de l'Année".

En tant que soliste, elle est l'invitée régulière de grands orchestres tels que : l'Orchestre Metropolitain du Grand Montréal, l'Orchestre National d'Ukraine, Solistes de Moscou, le BBC National Orchestra of Wales, l'Orchestre Musica Vitae de Suède, l'Orchestre Symphonique de Québec, l'Orchestre Symphonique de la RTV de Slovénie, l'Orchestre Philharmonique de Strasbourg, l'Orchestre National de Lille, l'Orchestre National de Lorraine, l'Orchestre de chambre d'Auvergne, l'Orchestre de Bretagne, l'Orchestre des Pays de Savoie...

En tant que chambriste, elle forme un duo depuis plusieurs années avec le pianiste Pascal Amoyel aux côtés duquel elle explore autant d'oeuvres inédites que de grand répertoire. En 2005-2006, ils créent ensemble le concert théâtral "le Block 15", mis en scène par Jean Piat, qui restitue les témoignages de deux musiciens sauvés par la musique lors de la seconde guerre mondiale. Ce spectacle fait l'objet d'une adaptation pour la télévision française.

Ses enregistrements parus chez Harmonia Mundi en solo ou en duo avec le pianiste Pascal Amoyel ont tous reçu les plus grandes récompenses discographiques : Cannes Classical Award, Diapason d'Or de l'année, R10 de Répertoire-Classica, Choc du Monde de la musique, ffff de Télérama...

Emmanuelle est Chevalier de l'Ordre des Arts et des Lettres.